Sebagai sebuah Kementerian yang bertanggungjawab dalam penyediaan pembangunan infrastruktur kepada Negeri Sabah, fungsi utama Kementerian ini adalah seperti berikut:-

Memberi keutamaan kepada penyediaan sistem jalanraya yang terampil dan selamat digunakan, samada di kawasan bandar ataupun luar bandar untuk pembangunan perindustrian, pertanian, perhutanan dan perlancongan;

Menyediakan dan menyelenggara perkhidmatan keretapi sebagai salah satu usaha ke arah meningkatkan pencapaian objektif sosioekonomi;

Menyediakan, membangunkan dan menaik taraf kemudahan-kemudahan pelabuhan;

Memberi keutamaan dalam menyediakan bekalan air bersih yang secukupnya kepada kawasan-kawasan bandar;

Mempercepatkan penyediaan bekalan air secukupnya kepada kawasan-kawasan luar bandar;

Menggalakkan sektor swasta mengambil bahagian dalam memberi khidmat pembekalan untuk menampung keperluan air di kawasan bandar yang semakin meningkat;

Menyediakan sistem perparitan yang terkini dalam kawasan bandar dan memastikan adanya penyelenggaraan yang sistematik secukupnya terhadap sistem pembentungan najis sehinggalah khidmat berkenaan diambil alih oleh kuasa-kuasa tempatan;

Urusetia kepada Jawatankuasa Penyelarasan Kemudahan-kemudahan Awam;

Badan Pengawalselia pelaksanaan Sistem Sesalur Sabah (Sabah Ducting System);

Mentadbir dan menyelaras aktiviti dan fungsi jabatan-jabatan dan badan-badan berkanun berdasarkan kepada kepentingan negeri iaitu:-
1. Jabatan Kerja Raya
2. Jabatan Air Negeri Sabah
3. Jabatan Keretapi Negeri Sabah
4. Jabatan Pelabuhan dan Dermaga
5. Lembaga Pelabuahn-Pelabuhan Sabah

Perkara ini adalah selaras dengan peruntukan-peruntukan berbagai undang-undang sebagaimana yang dinyatakan berikut:-
1. Enakmen Lembaga Pelabuhan-Pelabuhan Sabah (No. 9 tahun 1967);
2. Ordinan Keretapi (Bab 116);
3. Ordinan Perkapalan Saudagar (No. 11 tahun 1960);
4. Ordinan Bekalan Air (No. 16 tahun 1961).